Produk

Jalur molekuler patogen pada penyakit hati sirosis seperti virus hepatitis C (HCV), hepatitis autoimun (AIH) dan sirosis bilier primer (PBC) tidak ditandai dengan baik.Gen yang diekspresikan secara berbeda seringkali penting dalam patogenesis penyakit.Hibridisasi subtraktif supresi (SSH) adalah pendekatan seluruh genom yang memperkaya transkrip mRNA yang diekspresikan secara berbeda.Kami bertujuan untuk membuat pengamatan baru dari ekspresi gen diferensial pada sirosis menggunakan SSH yang dikombinasikan dengan reaksi berantai transkriptase polimerase balik (RT-PCR) kuantitatif real-time.Transkriptom hati pada sirosis HCV, sirosis AIH, PBC, dan jaringan hati yang tidak sakit diperiksa oleh SSH.Klon DNA komplementer (cDNA) yang dihasilkan disaring ulang untuk ekspresi diferensial dengan hibridisasi dot-blot dan kemudian diurutkan.Ekspresi gen yang dipilih dikuantifikasi dengan RT-PCR waktu nyata.Mengikuti SSH, 694 klon disaring ulang untuk ekspresi gen diferensial, 145 di antaranya diurutkan dan ditemukan berasal dari 89 gen berbeda.Tujuh klon hanya homolog dengan urutan tag urutan terekspresikan (EST) mengkode gen yang tidak memiliki fungsi yang diketahui.Ekspresi empat gen yang diatur ke atas dikonfirmasi oleh RT-PCR waktu-nyata: transmembran 4 anggota superfamili 3 (tetraspanin CO-029) dalam semua bentuk sirosis, protein interaksi landak (HIP) pada sirosis AIH dan kitinase 3-seperti-1 (HC gp-39 atau ykl-40) dan pengulangan asam arginin-glutamat (RERE) pada sirosis HCV.Polimorfisme gen RERE dan varian sambatan diamati pada semua jaringan yang diperiksa.Pengaturan naik Tetraspanin CO-029 terutama terlokalisasi pada sel duktular empedu.Kesimpulannya, pengamatan baru dari ekspresi gen diferensial pada sirosis manusia dilakukan dengan menggunakan SSH sebagai alat penemuan utama.Secara khusus, penelitian lebih lanjut tentang gen RERE dan produknya pada penyakit hati terkait HCV diperlukan.