Produk

Struktur 3D yang dapat diprediksi dari DNA untai ganda menjadikannya ideal sebagai templat untuk desain bottom-up dari situs aktif berbasis asam nukleat yang difungsikan.Kami di sini mengeksplorasi penggunaan dupleks DNA 14mer sebagai perancah untuk penentuan posisi fungsi katalitik yang tepat dan dapat diprediksi.Mengingat partisipasi di mana-mana dari kelompok imidazol berbasis histidin dalam pengenalan protein dan peristiwa katalisis, dupleks termodifikasi seperti histidin tunggal diselidiki.Menambatkan histamin ke C5 basa timin melalui ikatan amida, memungkinkan penempatan fungsi imidazol yang fleksibel di alur utama.Interaksi timbal balik antara imidazol dan dupleks dan pengaruhnya pada pKaH imidazolium diselidiki dengan menempatkan satu timin termodifikasi pada empat posisi berbeda di tengah heliks ganda 14mer.Dengan menggunakan NMR dan dinamika molekul tak terkendali, motif struktural yang melibatkan pembentukan ikatan hidrogen antara imidazol dan sisi Hoogste en dari basa guanin dari dua pasangan basa GC yang berdekatan terbentuk.Motif berkontribusi pada stabilisasi terhadap pelelehan termal 6°C dan merupakan kunci dalam memodulasi pKaH kelompok imidazolium.Fitur umum, prasyarat, dan karakter umum dari motif pengatur pKaH yang baru dijelaskan.