Produk

Wawasan mekanis ke dalam keluarga alfa-mannosidase yang bergantung pada Ca2+ dalam simbion usus manusia.

Bakteri kolon, dicontohkan oleh Bacteroides thetaiotaomicron, memainkan peran kunci dalam menjaga kesehatan manusia dengan memanfaatkan keluarga besar glikosida hidrolase (GH) untuk mengeksploitasi polisakarida makanan dan glikan inang sebagai nutrisi.Ekspansi keluarga GH seperti itu dicontohkan oleh 23 keluarga glikosidase GH92 yang dikodekan oleh genom B. thetaiotaomicron.Di sini kami menunjukkan bahwa ini adalah alfa-mannosidase yang bertindak melalui mekanisme perpindahan tunggal untuk memanfaatkan N-glikan inang.Struktur tiga dimensi dari dua mannosidase GH92 mendefinisikan keluarga protein dua domain di mana pusat katalitik terletak di antarmuka domain, memberikan bantuan asam (glutamat) dan basa (aspartat) untuk hidrolisis dalam Ca(2+)- cara tergantung.Struktur tiga dimensi GH92 yang kompleks dengan inhibitor memberikan wawasan tentang spesifisitas, mekanisme, dan jadwal konformasi katalisis.Ca(2+) memainkan peran katalitik kunci dalam membantu mendistorsi mannosida menjauh dari konformasi kursi keadaan dasarnya (4)C(1) menuju keadaan transisi.（Bibliografi: Nat.kimiaBiol.6, 125-32, (2010）

Kromatografi afinitas frontal dari glikoasparagin ovalbumin pada kolom A-sepharose concanavalin.Sebuah studi kuantitatif tentang spesifisitas pengikatan lektin.

Interaksi Sepharose 4B-immobilized concanavalin A (ConA) dengan 10 glikoasparagin yang berasal dari ovalbumin diselidiki secara kuantitatif dengan kromatografi afinitas frontal.Dalam metode ini, larutan karbohidrat diterapkan terus menerus ke kolom ConA-Sepharose dan keterbelakangan bagian depan elusi diukur sebagai parameter kekuatan interaksi.Konstanta disosiasi (Kd) untuk setiap sakarida dengan ConA dapat ditentukan.Analisis pengikatan p-nitrophenyl-alpha,D-mannoside telah menunjukkan bahwa sifat pengikatan ConA pada dasarnya tidak berubah setelah imobilisasi pada Sepharose 4B.Setiap glikoasparagin ovalbumin diberi label dengan tritium dengan metode metilasi reduktif untuk analisis.Perbandingan nilai Kd yang diperoleh menunjukkan bahwa pengikatan ConA sangat bervariasi dengan sedikit perbedaan struktur rantai glikosil.Hasilnya menunjukkan bahwa ConA mengenali struktur rantai glikosil spesifik, Man alpha 1-6(Man alpha 1-3)Man, di mana setidaknya satu gugus hidroksil pada posisi C-3 dari mannose terkait C-6 harus bebas.